در قسمت Tools این نرم افزار نیز یک Uninstaller تعبیه شده که همان کار Add or Remove Programs ویندوز را انجام می دهد، می توانید به آسانی برنامه های اضافی را از روی سیستم خود پاک کنید. و نیز یک StartUp برای کنترل برنامه هایی که هنگام بالا آمدن ویندوز اجرا می شوند و Ram سیستم را در بیشتر موارد، بی جهت اشغال می کنند.

قابلیت های  نرم افزار CCleaner v3.04.138:

• پاك سازی كامل هارد دیسك از برنامه های اضافی
• بهینه سازی ویندوز و بالا بردن سرعت آن
• رایگان بودن نرم افزار با قابلیت های بسیار زیاد
• CCleaner همیشه مجانی بوده و نیازی به کرک و سریال و ... ندارد
• قابلیت پاک کردن اطلاعات بطور عادی و امنیتی (NSA, DOD) را دارد
• عاری از هرگونه Spyware و Adware هست
• برای کار با آن افراد مبتدی نیز مشکلی نخواهند داشت
• پاكسازی فایل های موقت، history آدرس ها، کوکی ها در اینترنت اکسپلورر
• رفع مشکل پاک کردن History در IE7 ویندوز ویستا
• رفع مشکل در هنگام پاک کردن Clipboard
• اضافه کردن مرورگر Safari
• بهینه سازی دسترسی به File System
• به روز رسانی موتور نصب کننده برنامه
• و ...